另一边，
安室透和赤井秀一离开基地后，在地面上找了一圈后，却发现没有看到月见野的身影。
安室透突然有种不祥的预感，他看向一直在出口守着的风见裕也，语气慌乱道：
“风间，阿野呢，你见到她了吗？”
“月见小姐？我没见她出来过，降谷先生刚刚不是进去找她了吗？”
“什么？！！”
听到这话后，安室透跟赤井秀一心中那股不好的预感更加强烈了。
就在两人准备转身回去找月见野时，轰的一声，覆盖着整个地下基地的地面全部塌陷，连入口也轰然坍塌！
风见裕也看着瞬间就慌了神地降谷零和赤井秀一，赶忙出声安慰道：
“降谷先生别着急，月见小姐那么厉害，一定会没事的，说不定她只是从其他出口出来了。”
安室透心神不宁地点了点头，他和赤井秀一两人都下意识地忽略了心里可怕的猜测。
但是显然，往往你越害怕什么，就越会发生什么。
两人带着公安和FbI在附近都找遍了，也没有找到月见野的踪影。
两个人终于意识到了什么，疯狂地用手去扒那些倒塌的墙体……
等到救援人员终于挖到总控室的时候，时间已经过去了七八个小时。
他们最终只找到了两具尸体，其中一具尸体把另一具紧紧地抱在怀里，怎么掰都不松手。
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因为月见野当初给灰原哀的资料中就有这个洗脑药的资料，所以她最后也发现了月见野选择这种离开方式的原因。
众人最后从小哀口中得知了，清除记忆的这个药物的真相，它不仅会清除记忆细胞，还会加速脑细胞的死亡。
注射这个药后，生命就会被浓缩到三个月，最后会在头痛欲裂中逐渐走向脑死亡。
最好的结果就是变成一个永远也醒不过来的植物人。
灰原哀：“我想，月见姐姐应该是早就知道了你们一定想尽办法让她活下去，但她不愿让你们这样被一个已经死去的人拖住前进的脚步，她希望你们向前看，所以才会选择这种方式离开。”
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遗书内容
to 降谷零
‘安室先生，最后一次这么叫你了。
首先要恭喜你了，以后不用再继续负重前行了，你终于可以做回降谷零了。
以后，要往前看哦！你和景光松田终于他们光明正大的见面了，这一次你不再是孤单一个人了。’
安室透看完简讯的内容后，双眼通红猛地捶向了墙壁。
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to赤井秀一
‘秀哥，对不起，我这个妹妹是不是让你太不省心了，不过，就让我最后再任性一次吧。
我想这个时候，你们应该也从志保那里知道关于我的身体情况的事情了吧。
抱歉，在最后的几个月的生命里，我不想让你们在天天看着我痛苦，而自己却无能为力的煎熬中度过。
这样的死亡是我自己选择的，秀哥，不要自责，我从来都不后悔我当初的选择。
还有，哈哈哈，我突然有点好奇，詹姆斯先生如果知道我牺牲是我故意的，还会不会为我追封英雄称号了？
最后，世良，二哥和阿姨那里，就麻烦秀哥帮我解释了，替我跟他们说一声对不起。’
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to柯南
‘柯南，哦不，现在应该是工藤新一了，你以后一定要和小兰好好的哦！我的cp不能bE！！
还有，下次不要再丢下小兰了！
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to小兰和园子
对不起哦，我食言了，也失约了，有点遗憾没办法亲眼看到你们的婚礼了，但是，我相信你们一定会幸福的。
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to宫野志保
不论是选择成为小哀还是成为宫野志保，都要勇敢、快乐哦！因为志保＝至宝。
to詹姆斯朱蒂
詹姆斯先生，我很厉害吧！让我加入FbI可是你们最正确的决定了！！
还有，我这一走，秀哥就麻烦你们多多照顾了，一定要多给他介绍介绍，让他早点给我找个嫂子。
to贝尔摩德
贝姐，谢谢你一直以来的帮助，谢谢你的包容，谢谢你愿意站在我这边。
现在，你终于自由了，不再是苦艾酒，只是克里斯宾亚德！
to库拉索
千夏姐姐，不要为我悲伤，这是我自己选择的离开方式，要为我开心哦！
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最后的最后，一切的阴霾终于都散去了。
小哀选择了恢复宫野志保的身份，和姐姐一起搬到了博士隔壁的另一栋房子这样，为了方便照顾博士。
她成为一名优秀的医生，就算是为了以前自己赎罪，她不会再逃避她的命运了。
因为，虽不是她所愿，但Aptx让很多失去了性命这是事实。
工藤新一当然还是选择了当一名侦探，但小兰却做了跟毛利小五郎一样的选择。
她选择成为一名警察……
因为，她不愿意再做别人背后那个被保护的人，她也想保护自己在意的人。
妃英理与毛利小五郎拖拖拉拉，吵吵闹闹最后还是复合了。
听说服部平次也表白成功了，远山和叶跟小兰也选择了一起考入警校。
园子跟京极真依旧在一起，不过她不用继承家业，她对于做刑警真的没有天赋，所以最后选了交通部，还是可以跟小兰一起。
这还是宫本由美和佐藤美和子这对闺蜜给她的灵感呢！
世良真纯选择了留在日本，她最后跟赤井秀一一样选择加入了FbI。
安室透恢复降谷零的身份后，他申请了要休一段长假，之后就是每天都常驻波洛咖啡店，当一名普通的厨师店员。
好友经常在这里齐聚，来看他，他们都知道零的心结，但他们都无能为力。
赤井秀一处理完组织后续之后，也选择休假，他借口陪世良读书，留在了日本。
至于他到底为什么留下来，只有他自己心里清楚。
赤井玛丽吃下解药恢复后，因为工作的原因，就返回了英国。
朱蒂卡梅隆詹姆斯回国，詹姆斯虽然憨憨地，但是一直都没有放弃追朱蒂。