趁着高兴，在荀彧的安排下，刘琦折吉日纳娶祝融。长安城中一片喜庆。
新汉开元二年（204年）初，刘琦下令在三公九卿外另设军机处。太常荀彧任军机大臣，军机处成员由贾诩、田丰、步骘、蒯良、吕布等智谋超群或军事泰斗组成。全面监控天下军队及各地战事。刘琦常常参与其中。
军权集权制。
军机处只有参谋军事，商讨战略的权利，却无下达命令，调动兵力的权利。
但整个事情看上去却又不那么独裁专制。
其实只不过是刘琦知道一人智短的道理罢了。军机处包含了情报、后勤、装备等部门的主管，又囊括了刘琦手下最顶尖的知囊团队。刘琦想要的是尽可能的掌握天下兵事，尽量避免将在外逐渐坐大，而造成功高震主的局面。不是每个人都能看透，愿意轻易的放下手中的权力的。
这大概也是大多数开国之主会被历史所诟病的原因吧。但哪个皇帝愿意在天下大定后还兵权外落呢？
刘琦以前靠着一腔热血和兄弟情谊在这乱世中拼搏，不会去想这些问题。但现在各路大军全方位报捷，天下大定指日可待。他必须考虑如何安排一起打天下的这帮兄弟了。卸磨杀驴的事刘琦是做不出来，但战后的部队划分、人员调动、边境驻防等事务必须尽早安排。
军机处成立后，刘琦就亲自到场，关起门来跟荀彧、贾诩、田丰、步骘、蒯良、吕布几人推心置腹地聊了聊心里的想法。都是聪明人，当然能理解刘琦的顾虑和担忧。
易位而思，刘琦现在已高居九五之尊，高坐庙堂之颠，每次与众人相见除了朝堂便是未央宫中的议事大厅。被召见或谨见都是为了谈正事，至于谈心诉苦啥的对刘琦来说已经是一种奢望了。
但是刘琦知道打江山易，守江山难。如何让天下一统之后，手中的能臣猛将能够继续发挥才能，让大汉天下强盛不衰才是他现在工作的重中之重。朝堂上，君臣始终有不可接近的距离，这是天地君亲师的儒家思想根深地固扎下的影响，短时间很难改变。但大汉传承四百年中存在的弊端和缺陷却必须改变，比如士族、外戚、宦官争权夺利的隐患，比如封疆大吏拥兵自重的隐患……
军机处，名义上是总参军事的地方，但这时候权利却更加的大。因为这里包含了刘琦最信任的一群人，也是最有才能的一群人，他们才是大汉王权的根基所在。
这不是刘琦想把手中的麻烦推出去，而是把他心中的顾虑说出来，进而拉近与办事实的根基重臣间的距离。刘琦用行动向众人证明，自己虽然已经位居九五，手握无上致高的权力，但他依然是那个为大汉江山而呕心沥血，为天下百姓而鞠躬尽瘁的刘琦。
士为知己者死！
不得不说刘琦设立军机处这一行为还是收到了非常不错的结果的，包括早已不问政事的吕布都放开了心结全心地投入到军事讨论中了。
二月，冰雪开始融化的时候，北方再次传来捷报。
太史慈、法正、徐晃军团于年前平推了九州三十六国，连同邪玛台国和狗奴国一起剿灭。邪玛台国女王卑弥呼灭国自焚，狗奴国国主神武也没能开起东征的神话，被徐晃的战斧劈成了两半。整个岛群受到了远征军团的屠戮，尸横遍野，血流成河。除了收俘了一部分无知的山野村女为伤残解甲的士兵为妻外，倭岛本岛、四国岛、九州岛原居民尽数伏诛。
又一个民族就此灭绝。
大军暂留九州岛等待进一步指示。
真的是兵强马壮啊！
那个摆上军机处的巨大沙盘上，已经插满了红色的小旗。而太史慈军团的远征胜利，让刘琦手中的可用兵马又多了一路。
刘琦当即召见良臣张既，任命他为幽州刺吏，即日起程，到幽州赴任。并令其带去圣旨，调公孙康经韩郡渡海前往东瀛，将太史慈军团打下来的地盘设置瀛州。公孙康任州刺史，接手瀛州的建设工作。令太史慈军团跨海返回锦城海军基地，补给调备军队，让远征的损耗得到补充，保持军队的完整性。
接下来这三万海军和一万先驱营将士将会以奇兵的形式出现在中原战场，给敌人以致命一击。
经过几番商议，刘琦着军机处拟定最高军事命令下达至各战区。
着关羽军团分兵两路，关羽率第一军团出幽州收复中山、河间、常山、安平、巨鹿等地。
张辽从关羽军团中分兵十万，攻渤海郡，然后直达青州平原郡，进而攻伐青州。
高顺军团守住魏郡的同时，夺取赵国、清河国。
然后三路大军齐聚河水之北，全面施压兖州、青州。
赵云军团继续向伪都许昌施压，争取正面击破曹操主力。
南方周瑜军团、黄忠军团、甘宁军团水陆并进，兵进丹阳郡，寻刘备主力决战。
令诸葛亮军团出兵交州，尽量迫降孙权，然后沿海岸线北上收取会稽郡。
最后，令已从西域返回长安的张燕的黑山军、文聘的荆州军到灞桥集结，再从关中、荆州、河东等地征兵数万，集大军十万，刘琦要御驾亲征。大军拟定路线为东出函谷关，剑指雒阳。
皇帝亲征，天子统战，不是因为朝中已无统兵之将，也不是为了给自己的政治生涯凭添一抹色彩。而是刘琦为了亲眼见证最终的胜利和亲手了结英雄曹操、刘备的争霸人生。
荀彧、田丰、步骘、蒯良、吕布等人留守长安，同三公九卿一起辅佐太子刘铮参理朝政。
刘铮虽然才七岁，但生在帝王家就注定会失去很多童年的快乐，过早地接触政治。虽然他并不能决策什么，但早点参与，总是好事。有田丰、荀彧这么好的两位老师在，还有太上皇刘表坐镇，亲外公蔡邕教导，早早的培养也是好事。
留下荀彧是为了让军机处能够正常运行，田丰的治政能力不用怀疑，但毕竟年纪大了，精力有限。现在可不是一个小小的并州让他去打理，而是整个大汉天下。很多事，有王佐之才荀彧的果决与干练相助，会办得更轻松一些。